Desde 1969, Christopher Vaughan ha estudiado la vida silvestre costarricense y su relación con los seres humanos.
En 1979 obtuvo su maestría en Ordenamiento de Áreas Silvestres, otorgada por el CATIE-UCR. En el 2002 obtuvo su doctorado en Recursos Naturales en el Instituto de Estudios Ambientales, en la Universidad de Wisconsin-Madison, donde también fue profesor e investigador. En la actualidad es profesor asociado en dicha institución.
En 1985 cofundó el PRMVS, que incluía la primera maestría en Manejo de Vida Silvestre y el primer Centro de Documentación en Vida Silvestre en América Latina. Fue su primer director y además fungió como docente e investigador hasta el 2017. Asimismo, coeditó la revista Vida Silvestre Neotropical entre 1993 y el 2000. Del 2009 al 2014 dirigió el Programa de la Associated Colleges of the Midwest-Costa Rica. Ha sido autor, coautor, editor o coeditor de siete libros, y ha publicado 82 artículos científicos y 44 capítulos de libros. Sumado a ello, ha presentado 62 ponencias en congresos y simposios nacionales e internacionales. También dirigió los proyectos de tesis de 20 estudiantes.
Recibió el Premio de la Facultad de Tierra y Mar y el Premio Roberto Brenes Mesén, de la UNA (1995); el doctorado honoris causa del Grinnell College (2006), y el Premio de Biología Tropical (2014), otorgado por la Revista de Biología Tropical.
Desde 1990 coordina un proyecto de manejo in situ e investigación para la conservación de la lapa roja (Ara macao) en el Pacífico Central de Costa Rica, mediante el cual se ha logrado recuperar la población y cuadruplicar su distribución en la región.
Como complemento a esa conexión especial que tiene con la naturaleza, desde el 2009 es estudiante y practicante de budismo Shambhala.